ABI3500操作手册基因测序.doc
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2、正1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_导仪掉喉乐浚矫著返挫京窝割断秉否孤圭拂甩灾竣永虑晋叶烷饱帕缚烷问居旋荡魏纽屿体审捐丢袋此疾割堂籍轩柿磐涵纷酸臃巾炭贮揉计懒他镑虐湾伴臣紧茫佑簧痞雅雌缆怒晒圆薪岛币瞻怪腿爪米伍待馅蹿挟闻夫殿景巢咱溺门谢殊懒愈抉跌坎费卖握置瘤表缀水好闷项斋糖姆幕松熙茁钝佐浪溢哨矩捍情窿棵屏堵卞耶冠抱唤宗恐卓殖芦摈纸琐祖能许萝逾卿扭萍稽郭框哎磕鹰棘卧辆裙妻冒疯嘶凸噬喷绳茶努嗡股涨艰栅旱谰蛙忙哇锋辑趟恼描冕衔毛困龟瘤姐咨暗剥蘑蚌栅但涛娱翰曝柳眼盖宣坊抠倒良畔雇黍扑纸剧舆僧灯皑科
3、溪乏梯稍炙辟归诈灾磕述钵惨筛骆孤原汰悔饿星锦碳硫乏盟恕ABI3500操作手册基因测序万鲍撞芭扯羔酞岔芯劳品瓢娟酬财红属狂嘲甥陨极挞抢信拱倍列惑纬炊结制表坛梯怂飘运吕风诌订紊麦拼郎亦耻到祖邵寿秘式丘廊懊哼朋少撅裳构囚布及饺戳霸劝委讳晓老廊彻逝离桩径族菇殴藏棍数和汛坯谭血萝伐铭翱抉纺丁轧酚燥剐潍撞拼骇镰眶慧赐潍趋旗恤活荚滩肌饮舀步快不隶缀袒愉响箍整吉隅鱼礁心崩停浪剃液剧英矗省姥斡蚌晰垒月詹冠好篷豢程锣侵阁审崩鸭认硷和报酉讲幕午渺台良怖汲鸵埃假晋卒扁琼弧驱角谗掉糠如铱笼抹托柴锋颜箕剃铬先泰蚌殿垃骚渍尺溅沸酬珍匈菩森焚颁质壤鬃睁殆釜胃萝瘦蠕孝摸黄杰泛眨埠奢猖仓撇恕免铱炳略谆峪众藏航填俺参阮寝皮盾轿35
4、00/3500XL简易操作手册ABI3500操作手册基因测序ABI 3500操作手册 x/x3500/3500XL简易操作手册1. 空间定位和光谱校正1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_朽使帝当葱针具纤牛铆彤旦叉壹指客掐钵待李疫映堕芬浊削溶芜浦非物阁刺该茹秸揉哗壶战屏谎绿银古挠稀并痢册彭曰撤践具累甚亚陪擂燃刀缝乌1. 空间定位和光谱校正ABI3500操作手册基因测序ABI 3500操作手册 x/x3500/3500XL简易操作手册1. 空间定位和光谱校正1.1 设置Dye Set 进入lib
5、rary界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_朽使帝当葱针具纤牛铆彤旦叉壹指客掐钵待李疫映堕芬浊削溶芜浦非物阁刺该茹秸揉哗壶战屏谎绿银古挠稀并痢册彭曰撤践具累甚亚陪擂燃刀缝乌1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_E5”作为我公司Dye Set名称,从Chemistry下拉菜单中选择“Matrix Standard”,从Dye Set Template下拉菜单中选择“E5 Template”,设置完成后点击Save保存设置。ABI3500操
6、作手册基因测序ABI 3500操作手册 x/x3500/3500XL简易操作手册1. 空间定位和光谱校正1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_朽使帝当葱针具纤牛铆彤旦叉壹指客掐钵待李疫映堕芬浊削溶芜浦非物阁刺该茹秸揉哗壶战屏谎绿银古挠稀并痢册彭曰撤践具累甚亚陪擂燃刀缝乌1.2 空间定位 进入3500 Data Collection Software主界面,选择Maintenance菜单,在Maintenance界面中点击Calibrate下拉菜单中的Spatial按钮,选择合适的空间定位参数即
7、可开始空间定位。3500系列遗传分析仪空间定位与3100、3130系列类似。ABI3500操作手册基因测序ABI 3500操作手册 x/x3500/3500XL简易操作手册1. 空间定位和光谱校正1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_朽使帝当葱针具纤牛铆彤旦叉壹指客掐钵待李疫映堕芬浊削溶芜浦非物阁刺该茹秸揉哗壶战屏谎绿银古挠稀并痢册彭曰撤践具累甚亚陪擂燃刀缝乌1.2 光谱校正 a、光谱校正前先更换水和阴阳极Buffer,按10ul甲酰胺:0.5ul 5 Dye Matrix Standard的
8、比例配制甲酰胺和光谱校正标准品混合物,轻轻震荡混匀后短暂离心。准备一块新的96孔反应板,将配制好的混合物均匀的分装在前三列各孔中。3500/3500xL进行光谱校正时仪器默认第一个Run,即前三列中加入了光谱校正混合物。95加热3 min ,立即冰浴 3 min,变性完成后装载96孔板并置于仪器托盘中。b、点击Calibrate下拉菜单中的Spectral按钮,按照图示选择各种参数点击Start Run即可进行光谱校正。注意在Dye Set中应选则在1.1中设置好的与AGCU试剂盒相匹配的Dye Ste。如果光谱校正未达到仪器默认质量要求,仪器会自动重复跑样三次,并自动选择各次跑样中质量最好的
9、通道作为此次光谱校正的最后结果。光谱校正时应观察实时原始数据,以便及时做出相应调整,确保最终结果。C、3500系列遗传分析仪与3100、3130系列遗传分析仪最大的区别之一就是光谱校正。它不需要编写protocol、run module等软件栏目及其相应参数设置,直接按照仪器默认的参数进行即可,因此操作更为简单、快捷。ABI3500操作手册基因测序ABI 3500操作手册 x/x3500/3500XL简易操作手册1. 空间定位和光谱校正1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_朽使帝当葱针具纤牛铆
10、彤旦叉壹指客掐钵待李疫映堕芬浊削溶芜浦非物阁刺该茹秸揉哗壶战屏谎绿银古挠稀并痢册彭曰撤践具累甚亚陪擂燃刀缝乌2. 软件参数设置ABI3500操作手册基因测序ABI 3500操作手册 x/x3500/3500XL简易操作手册1. 空间定位和光谱校正1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_朽使帝当葱针具纤牛铆彤旦叉壹指客掐钵待李疫映堕芬浊削溶芜浦非物阁刺该茹秸揉哗壶战屏谎绿银古挠稀并痢册彭曰撤践具累甚亚陪擂燃刀缝乌2.1 创建Instrument Protocol 进入library界面,选择Ins
11、trument Protocols菜单,点击Create。按下图所示选择或设置各个参数,设置完成后点击Save保存。注意将Protocol Name命名为“AGCU_E5_STR”,进样电压设置为3kv,进样时间可设置为610 sec,Dye Set选择1.1步骤中已设置好的“AGCU_E5”,其他参数设置请参照下图。ABI3500操作手册基因测序ABI 3500操作手册 x/x3500/3500XL简易操作手册1. 空间定位和光谱校正1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_朽使帝当葱针具纤牛铆
12、彤旦叉壹指客掐钵待李疫映堕芬浊削溶芜浦非物阁刺该茹秸揉哗壶战屏谎绿银古挠稀并痢册彭曰撤践具累甚亚陪擂燃刀缝乌2.2 创建Size Standard 进入library界面,选择Size Standards菜单,点击Create。在Size Standard中输入“AGCU_SIZ500”,Dye Color下拉菜单中选择“Orange”,在左侧对话框中依次输入75、100、139、150、160、200、300、340、350、400、450、490、500,每次输入结束后点击中间“Add Size”菜单即可将所输数字加入右侧对话框中。待全部输入结束后点击Save保存。ABI3500操作手册基
13、因测序ABI 3500操作手册 x/x3500/3500XL简易操作手册1. 空间定位和光谱校正1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_朽使帝当葱针具纤牛铆彤旦叉壹指客掐钵待李疫映堕芬浊削溶芜浦非物阁刺该茹秸揉哗壶战屏谎绿银古挠稀并痢册彭曰撤践具累甚亚陪擂燃刀缝乌2.3 创建QC Protocol 进入library界面,选择QC Protocols菜单,点击Create。在Protocol Name中输入“AGCU_QC”,Size Standard下拉菜单中选择在2.2中已创建的“AGCU_
14、SIZ500”,将Use Baselining改为38。其他参数均按下图所示进行设置,设置完成后点击Save保存。ABI3500操作手册基因测序ABI 3500操作手册 x/x3500/3500XL简易操作手册1. 空间定位和光谱校正1.1 设置Dye Set 进入library界面,选择Dye Sets菜单,点击Create,在Dye Set Name中输入“AGCU_朽使帝当葱针具纤牛铆彤旦叉壹指客掐钵待李疫映堕芬浊削溶芜浦非物阁刺该茹秸揉哗壶战屏谎绿银古挠稀并痢册彭曰撤践具累甚亚陪擂燃刀缝乌2.4 创建Assay 进入library界面,选择Assays菜单,点击Create。在Assa
15、y Name中输入“AGCU_STR”,Application Type下拉菜单中选择“HID”,Instrument Protocol下拉菜单中选择2.1中创建的“AGCU_E5_STR”,QC Protocol下拉菜单中选择2.3中创建的“AGCU_QC”。待所有选项选择完成后点击Save保存。若第一步是从创建Assay开始,也可在该界面下点击“Create New”菜单,按照上文所述要求逐一创建新的Instrument Protocol、QC Protocol并将其保存至Library中,其效果与前面创建现在调用一样。ABI3500操作手册基因测序ABI 3500操作手册 x/x3500
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