分子生物学 5基因治疗ppt课件.ppt

基因治疗Gene Therapy,一、概念,经典的基因治疗：指正常的基因整合入细胞基因组以校正或置换致病基因的一种治疗方法。广义的基因治疗：将某种遗传物质转移到患者细胞内，使其在体内发挥作用，以达到治疗疾病目的的方法。,1.基因治疗分类,体细胞(somatic cell)基因治疗生殖细胞(germline)基因治疗,只限于某一体细胞的基因的改变只限于某个体的当代对缺陷的生殖细胞进行矫正当代及子代,1990年9月14日：第一例正式批准的基因治疗实验开始进行（美国，世界上开展基因治疗最早的国家）大规模进行基因治疗临床实验必须经历以下阶段：体外试验和动物试验 I期临床试验6-10名志愿者 II期临床试验20-30名志愿者 III期临床试验充分分析疗效、安全性中国：1991年7月开始进行基因治疗试验,2.基因治疗发展简史,世界上第一个正式被批准用于基因治疗的病例是先天性腺苷脱氨酶（ADA）缺乏症。1990年9月美国Blaese博士成功地将正常的人的ADA基因植入ADA缺乏症病人的淋巴结内，完成世界上首例基因治疗试验。,腺苷脱氨酶(ADA)缺乏的严重联合免疫缺陷(SCID),病因:淋巴细胞缺乏ADA酶 腺苷、dATP堆积 破坏免疫功能 患儿很少活到成年,第一个基因临床治疗的方案(1990.9.14,NIH),治疗策略：淋巴细胞ADA酶 恢复至正常水平的 5%-10%维持免疫系统功能 改善病人症状,治疗基本步骤:,ADA基因+逆转录病毒载体导入患者淋巴细胞体外扩增回输病人体内淋巴细胞ADA酶恢复至正常水平的5%-10%维持免疫系统功能,改善病人症状,一、基因治疗的策略,The Strategy of Gene Therapy,（一）基因置换（gene replacement）,定义：指将特定的目的基因导入特定细胞，通过定位重组，以导入的正常基因置换基因组内原有的缺陷基因。,目的：将缺陷基因的异常序列进行矫正。对缺陷基因的缺陷部位进行精确的原位修复，不涉及基因组的任何改变。,又称为基因打靶(gene targeting）定点整合的条件:转导基因的载体与染色体上的DNA具有相同的序列。带有目的基因的载体就能找到同源重组的位点，进行部分基因序列的交换，使基因置换这一治疗策略得以实现。,基因同源重组技术,要实现基因置换，需要采用同源重组技术使相应的正常基因定向导入受体细胞的基因缺陷部位。,定向导入的发生率约1/100万，采用胚胎干细胞培养的方法，这种同源重组的检出率最高可达1/10。,基因置换必要条件：,1、对导入的基因及其产物有详尽的了解2、外来基因能有效地导入靶细胞3、导入基因能在靶细胞中长期稳定存在4、导入基因能有适度水平的表达5、基因导入的方法及所用载体对宿主细胞安全无害,（二）基因添加,基因添加或称基因增补（gene augmentation）:通过导入外源基因使靶细胞表达其本身不表达的基因。,类型:在有缺陷基因的细胞中导入相应的正常基因，而细胞内的缺陷基因并未除去，通过导入正常基因的表达产物，补偿缺陷基因的功能；向靶细胞中导入靶细胞本来不表达的基因，利用其表达产物达到治疗疾病的目的。,基因干预(gene interference)指采用特定的方式抑制某个基因的表达，或者通过破坏某个基因而使之不表达，以达到治疗疾病的目的。,反义核酸：封闭基因表达核酶：裂解特异的靶mRNARNA干涉技术：,（三）基因干预,（四）自杀基因治疗自杀基因治疗:恶性肿瘤基因治疗的主要方法之一。原理:将“自杀”基因导入宿主细胞中，这种基因编码的酶能使无毒性的药物前体转化为细胞毒性代谢物，诱导靶细胞产生“自杀”效应，从而达到清除肿瘤细胞的目的。,自杀基因的作用机制,1.自杀基因系统,TK/GCV 单纯疱疹病毒（herps simplex virus,HSV）型胸苷激酶（thymidine kinase,tk）基因编码胸苷激酶，胸苷激酶特异性地将无毒的核苷类似物丙氧鸟苷（ganciclovir,GCV）转变成毒性GCV三磷酸核苷，后者能抑制DNA聚合酶活性，导致细胞死亡。,CD/5-FC 大肠杆菌胞嘧啶脱氨酶（cytosine deaminase,CD）基因，胞嘧啶脱氨酶在细胞内将无毒性5-氟胞嘧啶（5-FC）转变成毒性产物5-氟尿嘧啶（5-FU）。5-氟尿嘧啶通过竞争性抑制胸苷酸合酶的活性，从而抑制脱氧胸苷三磷酸的合成。,旁观者效应:“自杀基因”治疗不仅使转导了“自杀基因”的肿瘤细胞在用药后被杀死，而且与其相邻的未转导“自杀基因”的肿瘤细胞也被杀死。,2.旁观者效应,（五）基因免疫治疗,通过将抗癌免疫增强细胞因子或MHC基因导入肿瘤组织，以增强肿瘤微环境中的抗癌免疫反应。,二、基因治疗的必要条件,发病机制在DNA水平上已经清楚；要转移的基因已经克隆分离，其表达产物有详尽的了解；该基因正常表达的组织可在体外进行遗传操作；,外源基因可有效导入靶细胞外源基因能在靶细胞中长期稳定存留导入基因能适量表达导入基因的方法及载体对宿主细胞安全无害,理想的基因治疗还必须：,二、基因转移技术,The Technique of Gene Transfer,基因治疗途径,1、间接体内治疗途径（ex vivo)是先从患者体内取出某一器官组织的细胞，体外扩增后，将目的基因转入靶细胞形成表达外源基因的遗传修饰细胞，选择高表达的细胞扩增培养，以一定数量移植患者体内。（安全、易控制但操作复杂）2、直接体内治疗途径（in vivo）将目的基因体内直接转移到靶细胞，所用载体必须具有特异的导向性和转移效率。（操作简单但疗效短、免疫排斥等）,基因治疗的两种途径,载体,目的基因,in vivo,ex vivo,靶细胞,基因转移(gene transfer)技术：,1.病毒介导的基因转移系统。2.非病毒介导的基因转移系统。,1.病毒介导的基因转移系统,病毒载体介导的基因转移效率较高，因此它也是使用最多的基因治疗载体。据统计，有72%的临床实验计划和71%的病例使用了病毒载体，其中用得最多的是逆转录病毒载体。,具有包膜，圆球状，直径为80120nm基因组是单正链RNA，3.59.0kb病毒颗粒中有逆转录酶能整合于宿主细胞的染色体,（1）逆转录病毒（Retroviruses）,逆转录病毒颗粒结构,Reverse transcriptionIntegrationTranscriptionPackaging,Lifecycle of retrovirus,逆转录病毒整合入宿主DNA中的分子机制，其本质是转座,LTR(long-terminal repeat):长末端重复序列,Provirus(原病毒):被整合到细胞基因组中的逆转录病毒序列,Two fates of RNA:,Translation:作为mRNA翻译成病毒的蛋白质Packaging：作为病毒RNA基因组被装配成新的病毒颗粒,Everything is ready!,Packaging,2 RNAs in 1 virus,HIV 从受感染细胞的质膜出芽的情形,逆转录病毒的产生包括将RNA包装到衣壳中，然后从细胞的细胞膜上得到部分膜，出芽释放。,Genome Structure of Retrovirus,（1）两端各有一长末端重复序列LTR。,（2）LTR由U3、R和U5三部分组成。,(1)在U3内有增强子和启动子；(2)U3和U5两端分别有病毒整合序列(IS)；(3)在R内还有poly(A)加尾信号。,逆转录病毒前病毒的结构特点,（3）病毒有三个结构基因,(1)gag基因，编码核心蛋白；(2)pol基因，编码逆转录酶和整合酶；(3)env基因，编码病毒外壳或包膜糖蛋白(包括外膜糖蛋白和穿膜蛋白)。,（4）5端LTR下游有一段病毒包装所必需的包装信号序列（）及剪接供体位点(SD)和剪接受体位点(SA)。,逆转录病毒前病毒的结构特点,构成逆转录病毒介导的基因转移系统逆转录病毒载体由两部分组成：,(1)保留病毒颗粒的包装信号而缺失病毒蛋白基因,(2)辅助细胞株(如PA317)：它由缺陷型逆转录病毒感染构建而成,Retroviral packaging system,LTR,gag,pol,env,LTR,Gag蛋白,PoL蛋白,Env蛋白,包装细胞系,LTR,LTR,靶细胞,目的基因,标记基因,LTR,LTR,目的基因,标记基因,1,2,3,4,5,假病毒颗粒的产生并感染靶细胞,逆转录病毒载体,重组逆转录病毒(核酸部分只能是逆转录病毒载体),辅病毒,逆转录病毒载体的特点,逆转录病毒包膜上由env编码的糖蛋白，能够被许多哺乳动物细胞膜上的特异性受体识别，从而使逆转录病毒携带的遗传物质高效地进入靶细胞。,逆转录病毒结构基因gag、env和pol的缺失不影响其他部分的活性。,前病毒可以高效整合至靶细胞基因组中，有利于外源基因在靶细胞中的永久表达。,包装好的假病毒颗粒（携带目的基因的重组逆转录病毒载体）以芽生的方式分泌至辅助细胞培养的上清液中，易于分离制备。,逆转录病毒载体的主要缺点,随机整合，有插入突变、激活癌基因的潜在危险；逆转录病毒载体的容量较小，只能容纳7 kb以下的外源基因。,（2）腺病毒(adenovirus，AV)载体,腺病毒是一种大分子(36 kb)双链无包膜DNA病毒。它通过受体介导的内吞作用进入细胞内，腺病毒基因组转移至细胞核内，保持在染色体外，不整合进入宿主细胞基因组中。腺病毒是人类呼吸道感染的病原体，但目前尚未发现与肿瘤发生有关联。宿主细胞范围广，可感染分裂和非分裂终末分化细胞，如神经元等。,纤毛,腺病毒的优点,1.基因导入效率高，对人类安全；,2.宿主范围广；,3.基因转导与细胞分裂无关；,4.重组腺病毒可通过口服经肠道吸收、或喷雾吸入或气管内滴注；,5.腺病毒载体容量较大，可插入7.5 kb外源基因；,腺病毒载体缺点,2.宿主的免疫反应导致腺病毒载体表达短暂。,3.有两个环节可能产生复制型腺病毒。,4.靶向性差。,1.不能整合到靶细胞的基因组DNA中。分裂增殖快的细胞，导入的重组病毒载体，随分裂而丢失的机会增多，表达时间相对较短。,(1)腺病毒产生过程中与293辅助细胞内E1区序列发生同源重组；(2)腺病毒载体与被治疗的患者体内已感染的野生型腺病毒，甚至乳头瘤病毒、巨细胞病毒发生重组。,（3）腺病毒相关病毒载体,腺病毒相关病毒(adenovirus associated virus，AAV)是一类单链线状DNA缺陷型病毒。其基因组DNA小于5 kb，无包膜，外形为裸露的20面体颗粒。AAV不能独立复制，只有在辅助病毒（如腺病毒、单纯疱疹病毒、痘苗病毒）存在时，才能进行复制和溶细胞性感染，否则只能建立溶源性潜伏感染。,Structure of AAV Virus Genomic DNA,REP:病毒复制基因,CAP:编码衣壳蛋白的基因,AAV的特点,以潜伏感染为主；病毒基因组与细胞共存；只要宿主细胞正常，AAV基因表达就处于抑制而维持潜伏状态；若细胞受刺激，表达应激基因，AAV基因表达从而使AAV病毒复制；产生子代病毒并释放，又感染新的细胞，建立新的潜伏状态。,AAV载体是目前正在研究的一类新型安全载体，它对人类无致病性。AAV可以高效定点整合至人19号染色体的特定区域19q13.4中，并能较稳定地存在。这种靶向定点整合可以避免随机整合可能带来的抑癌基因失活和原癌基因激活的潜在危险性，而且外源基因可以持续稳定表达，并可受到周围基因的调控，兼具逆转录病毒载体和腺病毒载体两者的优点。,AAV载体的缺陷：,2.非病毒载体介导的基因转移系统,（1）脂质体介导的基因转移技术脂质体介导的基因转移技术使用方便、成本低廉。基本原理:利用阳离子脂质体单体与DNA混合后，可以自动形成包埋外源DNA的脂质体，然后与细胞一起孵育，即可通过细胞内吞作用将外源DNA（即目的基因）转移至细胞内，并进行表达。,脂质体介导的基因转移示意图,脂质体介导法缺点：脂质体介导进入靶细胞内，易被单核-吞噬细胞系统选择性吞噬、降解。,缺点：受体介导的DNA通常进入细胞溶酶体内被降解。,（2）受体介导转移技术,将DNA与细胞或组织亲和性的配体偶联，可使DNA具有靶向性。这种偶联通常通过多聚阳离子（如多聚赖氨酸）来实现。多聚阳离子与配体共价连接后，又通过电荷相互作用与带负电荷的DNA结合，将DNA包围，只留下配体暴露于表面。这样形成的复合物可被带有特异性受体的靶细胞吞饮，从而将外源DNA导入靶细胞。,受体介导转移技术示意图,（3）基因直接注射技术,不需要进行基因工程的繁琐操作，直接将裸露基因DNA注入动物肌肉或某些器官组织内。动物实验表明：接受注射外源DNA的小鼠能够按其基因编码合成相应的蛋白质，并能维持数月之久。1.将促进心脏血管生长的基因直接注入实验鼠的心脏，可使其心脏壁内毛细血管增加30%40%；2.将胰岛素基因直接注入鼠骨骼肌细胞，能分泌糖尿病所缺少的胰岛素；3.肌内注射凝血因子基因，可产生血友病所需的凝血因子等等。,基因直接注射法的优点,1.制备具有调控部件的质粒DNA重组体的技术较容易；2.排除病毒载体可能潜在的致癌性或其他副作用；3.导入的基因不需整合即可表达，避免了逆转录病毒载体导入整合后，一旦发生副作用不易中止或逆转的缺点；4.基因直接注射法可反复使用，而病毒载体则可能诱导体内免疫应答，致使反复治疗效果下降。,三、基因转移的靶细胞,靶细胞的选择须考虑：容易取出和移植。血液系统的细胞、成纤维细胞、成肌细胞；细胞具有较长的寿命离体细胞较易受外源基因转化离体细胞经转染和一定时间培养后再植回体内，仍较易成活,体细胞,生殖细胞,目前常用的靶细胞有：造血细胞皮肤成纤维细胞肝细胞血管内皮细胞淋巴细胞肌肉细胞肿瘤细胞,三、基因干预,Gene Interference,主要干扰特定细胞的mRNA转录和翻译,基因干预的种类：,1.反义RNA(antisense RNA)2.干扰RNA(RNA interference)3.核酶(ribozyme),（一）反义RNA,Definition:反义RNA（Antisense RNA)：指与靶RNA(或DNA)具有互补序列的RNA分子。,反义RNA技术,通过体外合成的反义RNA或构建能转录反义RNA的重组DNA质粒转入细胞中，利用碱基互补原理结合细胞中特异mRNA以调控其表达。,类反义RNA直接作用于靶mRNA的S D序列和(或)部分编码区，直接抑制翻译，或与靶mRNA结合形成双链RNA，从而易被RNA酶 降解；类反义RNA与mRNA的非编码区结合，引起mRNA构象变化，抑制翻译；类反义RNA则直接抑制靶mRNA的转录,1.根据反义RNA的作用机制分为,反义寡聚核苷酸（类）与mRNA特异性结合，阻断翻译过程,利用反义RNA对体外培养的细胞进行基因表达调控，通常采用的方法有两种：（1）体外合成反义RNA，直接作用于培养细胞，细胞吸收RNA后，发挥作用。缺点：RNA易降解（2）构建能转录反义RNA的重组质粒，将质粒转入细胞，转录出反义RNA而发挥作用缺点：细胞内转录的反义RNA量不易控制,2.反义RNA与基因表达调控,反义RNA的关键技术问题：,反义RNA进入靶细胞前的降解问题,专一性转移问题：如何解决某一组织、器官或系统中部分细胞病变进行专一性转移治疗。,3.受体介导反义RNA转移技术,受受体介导DNA转移方法的启发把DNA换成反义RNA，就可以实现受体介导的反义RNA的转移。,将脱唾液酸血清类粘蛋白（ASGP）与多聚赖氨酸（PL）共价连接，得到ASGP-PL复合物，成为运载核酸的工具。结合反义RNA，成为ASGPPL反义RNA复合物ASGP-PL反义RNA复合物可以专一性地被肝细胞表面的ASGP受体所识别，并吞噬到肝细胞中，反义RNA进入肝细胞后，可被逐渐释放出来发挥作用。,例：,受体介导的RNA转移十分专一，而且效率高；被转移的RNA是被保护的，与周围环境之间存在多聚赖氨酸的保护层,可以抵抗环境中的核酸酶的降解作用。,4.反义RNA的应用（一）,利用反义RNA的原癌基因失活疗法：阻止或抑制原癌基因的过度表达及抑制癌基因突变体mRNA成熟,原癌基因,调控细胞生长，增殖与分化正常情况下，表达受严格控制一旦调节失控，基因产物（生长因子，生长因子受体，胞内外传递信号等癌蛋白）分泌过剩，细胞恶性增生，致癌,根据已知癌基因的核苷酸序列合成反义RNA相应的反义寡聚核苷酸与肿瘤癌基因活化表达的mRNA的起始翻译位点结合成RNA/RNA双链体双链体阻止核糖体的结合，或核糖体沿mRNA上移，抑制翻译,治疗方法,抗HIV-l的作用：从翻译水平封闭基因表达，并干扰mRNA的剪切、加工而实现抗病毒作用,反义RNA的应用（二）,tat为HIV-l重要的调节基因，编码反式激活因子 Tat蛋白,它能增强HIV-1基因转录起始和延伸的效率.TAR序列是TAT激活HIV基因表达所必需的效应元件。处于LTR的R区内。Tat结合到TAR的茎环结构上。,Tat可与RNA结合因子一起以复合体形式结合在转录物的TAR序列上，并与装配在启动子处的转录起始复合体作用，这种作用导致TFH的激酶活性被激活，结果RNA聚合酶的羧基端结构域(CTD)实现磷酸化，使得RNA聚合酶前进，完成HIV转录单位的阅读，实现HIV蛋白的大量合成。,抗HIV-l策略,在逆转录病毒启动子LTR之后连接反义tat与多聚TAR的构建物(LTR-25TAR-AS-TAT)，具有反义tat及TAR诱饵的双重作用,gag是HIV-1的结构基因，编码p24等病毒结构蛋白Veres等构建了逆转录病毒载体，在细胞内表达互补于gag区不同长度的反义RNA(225-1225nt)在CEM-SS T细胞及外周血CD4细胞均有抑制HIV-l复制的作用长片段反义RNA的抗HIV-l作用更好，可能由于它能与不同种的HIV-l RNA结合而限制了病毒的逃逸,3.反义RNA的应用前景,受体介导的反义RNA基因治疗有其自身的优点，而在一定程度上补充了转基因治疗的不足。,（l）安全性高,（2）反义RNA设计 和制备方便,（3）具有剂量调节效应,（4）能直接作用于一些RNA病毒,反义RNA只作用于特异的mRNA分子，不改变所调节基因的结构。反义RNA分子无论怎样修饰，最终将在细胞内部被降解，不留“残渣”。,在治疗RNA病毒感染性疾病时，受体介导的反义RNA基因治疗比一般的DNA基因治疗有更大的优势。利用反义RNA可以直接作用于病毒RNA，阻断RNA病毒的繁殖。,1.RNA干扰现象,（二）干扰RNA,对RNA干扰的认识来源于用线虫（C.elegans）和果蝇所进行的实验。实验结果显示，有义链RNA（sense RNA）或反义链RNA（antisense RNA）均能抑制线虫基因的表达，双链RNA比单链RNA更为有效。将特异的双链RNA注入线虫体内可抑制有同源序列的基因的表达。得到的结果是有义链RNA和反义链RNA都同样阻断基因表达途径。这与传统上对反义RNA技术的解释正好相反。而且其抑制基因表达的效率比反义RNA至少高2个数量级。,RNA干扰（RNA interference，RNAi）是一种由双链RNA诱发的基因沉默现象。在此过程中，与双链RNA有同源序列的信使RNA（mRNA）被降解，从而抑制该基因的表达。,2.RNA干扰的机制,RNA干扰过程主要有2个步骤：,（1）小干扰性RNA（siRNA）,（2）siRNA与细胞内的某些酶和蛋白质形成复合体，称为RNA诱导的沉默复合体（RNA-induced silencing complex,RISC)。,该复合体可识别与siRNA有同源序列的mRNA，并在特异的位点将该mRNA切断。,长双链RNA被细胞内的双链RNA特异性核酸酶Dicer切成21-23个碱基对的短双链RNA，称为小干扰性RNA（small interfering RNA，siRNA）。,siRNA反义链可作为引物。与mRNA结合，并以其为模板，在依赖于RNA的聚合酶催化下合成新的dsRNA。Dicer切割成siRNA，再识别新的mRNA。这是RNAi的高效性和持久性的原因。,A.贾第鞭毛虫Dicer的晶体结构；RNA干扰机制示意图,1.体外化学合成;,2.用质粒载体或病毒载体可在细胞内稳定地生成。,siRNA的产生,3.RNA干扰的应用前景 RNA干扰研究目前已经在功能基因组学研究、微生物学研究、基因治疗和信号转导等广泛领域取得了令人瞩目的进展，使其在医学、生物学领域的应用有着广阔的前景。,（1）研究基因功能的新工具,由于 RNA干扰技术具有高度的序列专一性和有效的干扰能力，可以使特定基因沉默或功能丧失，因此可以作为功能基因组学的一种强有力的研究工具。,RNA干扰技术能够在哺乳动物中抑制特定基因的表达，建立多种表型；抑制基因表达的时间可以控制在发育的任何阶段，产生类似基因敲除的效应。,（2）肿瘤的基因治疗,传统反义RNA技术诱发的单一癌基因的阻断，不可能完全抑制或逆转肿瘤的生长，而RNA干扰技术可以利用同一基因家族的多个基因具有一段同源性很高的保守序列这一特性，设计针对这一区段序列的双链RNA分子，只使用一种双链RNA即可以产生多个基因同时剔除的表型，也可以同时使用多种双链RNA而将多个序列不相关的基因同时剔除。RNA干扰技术可用于治疗有异常基因表达的恶性肿瘤。,K-ras蛋白为肿瘤发生所必需，bcr/ab1融合基因与人白血病有关，用RNA干扰技术可以阻碍K-ras蛋白的表达从而抑制肿瘤发生，或杀死有bcr/ab1的人白血病细胞系。通过RNA干扰抑制某些内源性基因的表达，能促进白血病细胞系的细胞凋亡或增加其对化疗药物的反应性。,（3）病毒性疾病的基因治疗,RNA干扰可以被看成是一种与免疫系统类似的防御机制。用siRNA抑制人类免疫缺陷病毒（HIV）某些基因的表达，如P24、Vif、nef、tat或rev，阻碍HIV在细胞内复制。用RNA干扰技术抑制HIV的受体（CD4）或辅助受体（CXCR4或CCR5）在细胞内表达，可阻碍HIV感染细胞。也可通过RNA干扰抑制其他病毒在细胞内复制，如脊髓灰质炎病毒、人乳头状瘤病毒、乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒等。,siRNA在病毒感染的早期阶段能有效地抑制病毒的复制，病毒感染能被针对病毒基因和相关宿主基因的siRNA所阻断，RNA干扰技术将成为一种有效的抗病毒治疗手段。这对于许多严重的病毒性疾病的防治具有十分重大的意义。,（三）核酶(ribozyme)用于基因治疗,天然核酶多为单一的RNA分子，具有自我剪切作用。但核酶也可以由两个RNA分子组成。,在基因治疗时，利用核酶分子结合到靶RNA分子中适当的邻位，形成锤头核酶结构，将靶RNA分子切断，通过破坏靶RNA分子达到治疗疾病（如清除病毒基因组RNA）的目的。只要两个RNA分子通过互补序列相结合，形成锤头状的二级结构（3个螺旋区），并能组成核酶的核心序列（13个或11个保守核苷酸序列），就可在锤头右上方产生剪切反应。,锤头型核酶的二级结构 和空间立体结构示意图,三个双螺旋区13个核苷酸残基保守序列剪切反应在右上方GUX序列的3端自动发生,（N代表任意核苷酸，H代表A,U或C）,1.核酶的设计,核酶是通过靶RNA分子与核酶分子共同组成酶活性结构域，要从靶分子和核酶分子两个方面来设计核酶。,（1）选择合适的靶部位，该部位具有核酶切割位点，能与核酶分子结合并组成酶活性结构域。,（2）核酶的基本组成：用于基因治疗的核酶分子由三个部分组成，中间是保守序列（能够组成酶活性结构域），两端是引导序列。,在基因治疗中，主要是根据治疗的靶基因序列的特点，设计和合成特定的核酶。设计的基本原则是核酶分子与靶部位结合后能形成酶活性结构域。,核酶的作用机制,2.核酶的应用,与一般的反义RNA相比，核酶具有较稳定的空间结构，不易受到RNA酶的攻击。更重要的是，核酶在切断mRNA后，又可从杂交链上解脱下来，重新结合和切割其它的mRNA分子。,核酶导入细胞方法,1、外源导入法：可以通过化学合成；也可以采用体外转录方法2、内源导入法：利用表达载体在细胞内转录产生核酶分子。,新技术 新思路,设计出具核酶活性的反义RNA，既能与mRNA互补结合阻止mRNA的翻译，又带有锤头状结构基因，能对靶序列（mRNA）特异性切割，可反复使用,补充：PCR衍生技术,逆转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)定量PCR(quantitative PCR)多重PCR(multiplex PCR)差异显示PCR(differential display PCR,DD-PCR)原位PCR(in situ PCR),一、逆转录PCR（RT-PCR）,以细胞内总RNA或mRNA为材料进行体外扩增的技术。主要用于克隆 cDNA、合成cDNA探针，检测RNA病毒、分析基因表达等,逆转录生成cDNA方式：以随机进行的PCR扩增所需的下游引物作为逆转录反应的引物以oligo(dT)作为引物，mRNA3末端polyA尾与之互补,二、多重PCR,在同一反应体系中加入多对引物，同时扩增一份DNA样本中多个不同序列的靶片段。,DMD基因外显子缺失的检测,三、差异显示PCR（differential display PCR,DD-PCR）,一种以逆转录PCR为基础的研究基因表达差异的技术。原理是，利用一系列的oligo(dT)引物，逆转录真核生物细胞中全部表达的mRNA，通过PCR扩增的方法，转换成cDNA双链，再利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳，将有差异的片段分开，筛选出目的基因。DD-PCR主要用于肿瘤和多种疾病的分子遗传学研究，是目前筛选基因表达差异最有效的方法。,(1)提取总RNA，(2)在逆转录酶作用下，以Oligo T 为引物，进行逆转录；(3)PCR反应，扩增cDNA的第一条链；(4)扩增后的cDNA进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，使差异表达的cDNA片段在6%测序胶上分开；(5)找出不同处理间差异显示的条带，并回收，(6)克隆差异片段，差异片段可作为探针；(7)Northern 杂交，验证目的片段，去掉假阳性片段；(8)对目的片段进行测序；(9)以克隆的目的片段为探针，从基因组文库中筛选出相应的全长基因。,