医学文献检索课件.ppt

医学文献检索,美国文献家赫伯特说：“知识的一半，是知道到哪里去寻找它。明日的文盲，不是不能阅读的人，而是缺乏检索能力的人。,英国的大文豪塞缪尔约翰逊（Samuel Johnson）说：知识分成两类，一类是我们要掌握的学科知识，另一类是要知道在哪儿可以找到有关知识的知识。,美国科学基金会凯斯工学院基金委员会、日本国家统计局的数字,引自田纳西大学Carol Tenopir的研究报告,科技文献检索与科研,科技人员要从浩如烟海的文献洪流中快、全、准地查到所需相关资料，就应该了解文献检索的知识和方法，掌握检索基本功。,教学要求,学时：24学时学分：1学分？教学方式：理论与上机实习相结合 考核方式：平时成绩占20%，上机考试成绩占80%。地点：理论与实习课均在图书馆电子阅览室A201,第一讲,第一节 文献信息基础知识与信息素养第二节 医学文献信息资源第三节 医学文献信息检索基础第四节 检索效率的评价第五节 影响检索效率的因素与提高 措施,第一节 文献信息基础知识,1.1 信息、知识、情报、文献1.2 信息素养,1.1 信息、知识、情报与文献P4,1、信息(information) 是对客观世界中各种事物的存在或运动形式与状态的表现形式或反映，是客观事物之间相互作用和联系的表征；是客观事物经过感知或认识后的再现。 简单说信息就是人脑对事物或现象的反映。 在人类社会中，信息是以语言、文字、符号、图形、声波、光波、电磁波等形式传递，以纸张、胶片、磁带、光盘等作为纪录知识的载体来表示。信息是不同于物质和能量的一种特殊资源。,2、知识(knowledge) 知识是人类在认识和改造客观世界实践中获得的对事物本质的认识和经验的综合，是人们通过实践对客观事物及其运动过程和规律的认识与总结。 知识是一种特定的人类信息，是信息的一部分，是对信息进行提炼和深化的结果。知识经过不断提高和深化，形成较为完整的科学知识体系。,3、情报(intelligence) 情报是用来及时传递的有用的知识。 情报来源于知识，必须在特定的时间内经过及时传递，并能为用户所接受和利用。情报具有知识性、传递性和效用性。,4、文献(documents, literature) 是指以文字、图像、公式、声频、视频、代码等手段将信息、知识记录或描述在一定的物质载体上，并能起到存贮和传播信息情报和知识作用的一切载体。 文献是记录有知识的一切载体。 文献由三个基本要素构成：内容上的知识或信息；揭示和表达知识信息的标识符号；记录信息符号的物质载体。内容是关键，符号是表现形式，载体为文献存在方式。,信息、知识、情报的关系,综上所述，将客观事物产生的信息升华到理论化和系统化就形成了知识，再将知识记录在一定的物质载体上就形成了文献。文献是信息、知识、情报的主要载体形式。而人类社会利用文献或文献进行交流，其实质是利用和交流文献中的信息、知识。,信息、知识、情报的关系,范围从大到小：信息知识情报,1.2 信息素养,1.1.1 信息素养的概念1.1.2 医学生信息素养能力标准(美国高等教育信息素养能力标准),1.1.1 信息素养概念：是指判断何时、何地需要信息，并有效地定位、获取、评价和利用信息的一系列能力的总和。包括信息意识、信息技能和信息道德。信息意识：亦称信息观念，是人们对信息需求的自觉反应，即对信息的捕捉、分析、判断和吸收的敏感性。信息技能：是人们有效快速地获取、加工、存储、利用和传递信息的能力。 信息道德：在整个信息活动中，信息的创建者、信息服务提供者和信息的使用者所必须遵守的社会法律法规和行为准则。,1.1.2 医学生信息素养能力标准(美国高等教育信息素养能力标准),标准一：有信息素养的学生有能力决定所需信息的性质和范围。 标准二：有信息素养的学生可以有效地获得需要的信息。 标准三：有信息素养的学生能评估信息和它的出处，然后把挑选的信息融合到他（她）们的知识库和价值体系。标准四：不管个人还是作为一个团体的成员, 有信息素养的学生能够有效的利用信息来实现特定的目的。 标准五：有信息素养的学生熟悉许多与信息使用有关的经济、法律和社会问题，并能合理合法的获取信息。,第一讲,第一节 文献检索与信息素养第二节 医学文献信息资源第三节 医学文献信息检索基础第四节 检索效率的评价第五节 影响检索效率的因素与提高 措施,第二节 医学文献信息资源,2.1、文献信息资源的类型与特征2.2、图书馆文献信息资源利用2.3、图书馆信息服务2.4、数字化图书馆,2.1 文献信息资源类型的划分,1、按文献载体类型划分：P9 书写型文献 印刷型文献 缩微型文献 视听型文献 电子型文献：按发布形式可划分为以下几种：参考数据库、全文数据库、事实数据库、搜索引擎/分类指南、网络学术资源学科导航、FTP资源、其他,2、按文献出版形式划分 图书 专利文献 期刊 产品资料 科技报告 技术标准 学位论文 技术档案 会议文献 政府出版物3、按文献加工深度划分 一次文献 二次文献 三次文献,按文献内容加工深度分: 零次文献:也称灰色文献，是指未经正式发表或未融入正式交流渠道的最原始的文献，如书信、手稿、实验数据、观察记录、笔记、内部档案等。 特点：内容新颖，但不成熟，难以查询。,一次文献：是指以著者本人的研究成果（如实验、观察、调查研究等结果）为依据而创作的原始文献，如期刊论文、专利说明书、会议论文、学位论文、科技报告等。 特点：内容新颖、详尽，因而是文献信息的最主要来源和检索对象，但其量大、分散而无序，对其查找与利用带来不便。,二次文献：是对大量的、分散的、无序的一次文献信息经过加工整序后而形成的文献。如目录、索引和文摘等。特点：报道性和检索性，主要作用是提供查找文献信息的线索，故又称为检索工具。三次文献：是将分散无序的某一范围的一次文献，经过综合整理后而重新组织成有条理有定评的文献，如综述、进展、年鉴和百科全书等。特点：对知识信息具有浓缩性和综合性的特点，同时兼有检索文献的作用。,零次文献、一次文献、二次文献及三次文献之间的关系： 零次文献是形成一次文献最基本的素材；一次文献是信息的主要来源和检索对象；二次文献是检索的手段和工具；三次文献既是检索对象，同时也具有检索文献之功能。,第一讲,第一节 文献检索与信息素养第二节 医学文献信息资源第三节 医学文献信息检索基础第四节 检索效率的评价第五节 影响检索效率的因素与提高 措施,第三节 医学文献信息检索基础,3.1 文献检索概念及类型3.2 检索语言及检索原理3.3 检索工具3.4 检索的方法、途径及步骤3.5 检索方式,3.1 文献检索的概念及类型,文献检索：指从文献信息集合中查找所需文献或文献中包含的信息内容的过程。广义的文献检索包括存储和检索两者的过程和技术。而狭义的文献检索是从用户的角度来理解，仅指从已经存贮的具有检索功能的文献信息集合中查询出所需文献的过程。,3.1 文献检索概念及类型,文献检索属于信息检索的范畴，后者根据检索对象的不同，有文献型信息检索、数据型信息检索和事实型信息检索。文献型信息检索（Document retrieval） 利用文献的内部和外部特征来查找所需的论文，综述 等等。其检索结果是切题文献或相关文献的文献线索或具 体的文献。例如，查找国内外有关“PCR诊断病毒性肝炎”方面的研究文献 数据型信息检索（Data retrieval） 直接提供所需的确切的数值性数据。事实型信息检索（Fact retrieval） 直接提供用户所需的确切的非数值性数据，即事实。如化学式的检索、人物数据库、机构名录数据库、产品或商品信息数据库以及指南库、术语数据库等。,文献检索按其揭示内容的程度有题录检索、文摘检索和全文检索；按检索手段有手工检索和计算机检索；按检索标识有分类检索、主题检索、著者检索等。文献检索具有继承和借鉴前人成果，避免科研重复劳动和节省查找文献时间和精力的作用。,第三节 医学文献信息检索基础,3.1 文献检索概念及类型3.2 检索语言及检索原理3.3 检索工具3.4 检索的方法、途径及步骤3.5 检索方式,3.2 检索语言及检索原理,3.2.1 检索语言的概述3.2.2 检索语言的分类3.2.3 检索的原理,3.2.1 检索语言的概述,一、概念：P30 又称标引语言或索引语言，是用于描述文献检索系统中文献的内容特征及外表特征和表达用户检索提问一种专门的标识系统。 检索语言由检索标目（检索系统中的特征标识，也称检索词、索引词、标引词等）和语法组成（利用标目查找文献的一整套规则）。,3.2.2 检索语言的分类,（一）、按照检索语言中所使用语词的受控情况划分1、规范语言：又称受控语言、人工语言（Artificial Language）,是一种采用经过人工控制的规范性的词语或符号作为检索标目，来专指或网罗相应概念的一种检索语言。规范化的标目能较好地对同义词、近义词、相关词、多义词及缩略词等概念进行规范。例：tumor、tumour、cancer、carcinoma、neoplasms受控语言规定只能用其中一个词表示“肿瘤”这个概念，即：neoplasms。 2、非规范语言：又称非受控语言、自然语言（Natural Language）,是采用未经人工控制的词语或符号作为检索标目的一种检索语言。（自由词、关键词。无法用规范词准确表达或新出现的词语）,（二）按照检索语言所描述的信息特征划分1.描述信息外部特征：文献的书名、刊名、篇名、著者、译者、出版社等2.描述信息内容特征：分类检索语言、代码检索语言、主题检索语言。,分类检索语言：用分类号作为语言来表达各种概念。按学科、专业集中文献，从知识分类的角度揭示多种不同文献在内容上的区别和联系，提供以学科分类为出发点的文献信息检索途径。常用的分类法：美国国会图书馆图书分类法杜威十进分类法国际十进分类法中国图书馆分类法国际疾病分类,中图法以各门学科的特点和规律为基础，按照知识门类的逻辑次序，将学科划分为五个基本部类、22个基本大类。五个基本部类为：马克思主义、列宁主义、毛泽东思想，哲学，社会科学，自然科学，综合性图书。基本大类的类号及其类目名称如P14,如中国图书分类法（简称中图法）R 医药卫生 R1 预防医学卫生学 R2 中国医学 R3 基础医学 R4 临床医学 R5 内科学 R6 外科学 R71 妇产科学R72 儿科学 R73 肿瘤学R74 神经病学与精神病学 R75 皮肤病学与性病学 R76 耳鼻咽喉科学 R77 眼科学 R78 口腔科学 R8 特种医学 R9 药学,可细分至六、七级类目，如 ：R6 外科学 R65 外科学各论 R655 胸部外科学 R655.1 胸壁 R655.2 胸膜 R656 腹部外科学 R656.1 急腹症 R656.2 腹部疝 R656.3 腹壁 R656.31 腹壁炎症 R656.32 腹壁损伤,中国图书馆分类法分类号标记是汉语拼音字母与阿拉伯数字相结合的混合制号码。 为了区别于一般图书，对教材、工具书等，在其分类号后加复分号，如R245-61（针灸辞典），R711-43（妇科学教材）。 对于临床各科（R5-R8），有专门复分表：01 预防、控制和卫生02 病理学、病因学03 微生物学、免疫学04 诊断学05 治疗学06 并发症07 预后08 诊疗器械、用具09 康复例：R511.3-05 天花治疗学,主题检索语言：以反映文献内容的主题词或关键词作为文献存储和检索的标识。常见主题检索语言：主题词又称叙词：严格规范化、可进行概念组配、具有完善参照系统、具有范畴索引等关键词：以出现在文献的标题、摘要或全文中能表达文献实质内容的词或关键性专业名词术语作为检索标识,例：关键词tumor、tumour、cancer、carcinoma、neoplasms主题词规定只能用其中一个词表示“肿瘤”这个概念，即：neoplasms。 关键词：缩窄性心包炎，皮克心脏病 主题词：心包炎，缩窄性,医学主题词表（MeSh),在进行检索时，用户输入一个主题词后，系统会自动显示该主题词所能组配的副主题词。MeSh有一个副主题词表，1989-1990年IM使用的副主题词是77个，1991-1994年是80个，每年略有变化。目前IM使用的副主题词是83个。副主题词(Subheadings)又称限定词(Qualifiers)，与主题词进行组配，对某一主题词的概念进行限定或复分，使主题词具有更高的专指性。如诊断（Diagnosis，DI）、药物治疗（Drug Theray，DT）等。正确选择副主题词也很关键。,医学主题词表（MeSh),在医学主题词注释字顺表MeSHAAL中，对每个范畴类目的主题词和副主题词的组配原则进行了严格规定，组配时要按照规则进行。例如，副主题词治疗therapy与疾病主题词组配，可用于综合疗法。例如，消化性溃疡的药物疗法，用消化性溃疡/治疗；药物疗法副主题词治疗应用therapeutic use 与药物、生物制品和物理作用物主题词组配。指用于预防和治疗疾病，包括兽医用药。例如，红霉素治疗链球菌感染，用红霉素/治疗应用；链球菌感染/药物疗法。,代码检索语言,代码检索语言：用代表事物的代码作为标识系统的索引语言。（化合物分子式索引、环状化合物环系索引、化学物质号索引等）,3.2.3 检索的原理,第三节 医学文献信息检索基础,3.1 文献检索概念及类型3.2 检索语言及检索原理3.3 检索工具3.4 检索的方法、途径及步骤,3.3 检索工具,检索工具是将所收录的文献按一定的规则编制而成的具有存贮、检索和报道文献线索功能的工具。3.3.1、检索工具的特点：对所收录文献的各种特征给予必要的描述，以形成各种文献款目；对每条款目进行标引，形成检索标识，以作为排序与检出的依据；将全部款目有序化组织成为一个有机整体，使之易于存取；编制与提供多种检索手段，以便从各个角度查检文献。,3.3.2 检索工具的功能： 存贮功能 检索功能 报道功能,3.3.3 检索工具的类型按对信息收录的学科范围划分：P28 综合性数据库 专业性数据库 专题性数据库,按收录信息内容的类型不同划分：P28 文献型数据库：包括书目数据库和全文数据库 数值型数据库 事实型数据库 图像数据库 多媒体数据库,第三节 医学文献信息检索基础,3.1 文献检索概念及类型3.2 检索语言及检索原理3.3 检索工具3.4 检索的方法、途径及步骤,3.4 文献检索的方法、途径和过程,1、检索方法（1）追溯法： 通过已知文献后附有的参考文献中提供的线索来查找文献。（2）常用法：利用各种检索工具来查找文献。它又分为顺查法、倒查法和抽查法。（3）循环法：是将常用法和追溯法交替使用的一种综合文献检索方法。 （4）浏览法： 是从本专业期刊或其它类型的原始文献中直接查阅文献资料。,常用法,顺查法 按照时间顺序由远及近逐年查找文献的方法。一般用于重大课题和各学科发展史以及新兴学科等方面的研究课题的全面检索，一般已知课题开始年代。如查找“有关SARS的文献” 。查新规定检索十年或十五年的文献倒查法 按照时间顺序由近及远回溯性逐年查找文献的方法。科研人员常用的检索方法。适用于一些新课题或有新内容的老课题，或在确认某项成果是否有创新时，也适合采用倒查法抽查法 针对某学科或某课题研究的特点，根据文献资料发表集中的年代或时期，抽出其中一段时间进行文献检索的方法。多用于写专题调查报告。,2、检索途径（1）著者途径：利用已知著者姓名作为检索标识进行文献查检。（2）分类途径：利用特定分类体系的分类号或分类类目作为检索标识进行文献查检。（3）主题途径：利用反映文献主要内容的主题（词）作为检索标识进行文献查检。（4）其他途径：利用特定的检索标识进行文献查检。,使用主题途经应注意的问题: 1. 选用主题词的概念要适当，不能太广或 太狭。P34 2. 选用主题词，应从事物的“专有名词”来考虑，不要从“过程词”来考虑。 3. 要注意主题词的倒置形式。 4. 主题词与副主题词之间的组配。,医学文献检索的步骤,检索策略是为实现检索目标而制定的全盘计划或方案一、分析检索课题1.目的是使用户清楚其课题要解决的实质问题。是制定检索策略的根本出发点，也是检索效率高低或成败的关键2.明确检索目的及要求（课题所属的学科范围、要求的文献类型、年限、语种等） 二、选择检索工具1.手工检索工具（目前很少读者使用此方式）2.计算机检索系统：根据课题内容，选择合适数据库,检索步骤,三、选择检索方法1.常用法2.追溯法3.分段法四、确定检索途径1.反映文献内容特征： 主题途径、分类途径等2.反映文献外部特征： 著者途径、书（刊）名途径、 代码途径3. 用逻辑运算符构造提问表达式五、根据检索结果，调整检索策略，必要时对检索词或检索式进行修改，直至检出结果符合要求六、根据文献线索，获取原始文献,第一讲,第一节 医学生信息素质相关知识第二节 文献信息基础知识第三节 文献检索概述第四节 检索效率的评价第五节 影响检索效率的因素与提高 措施,第四节 检索效率的评价,检索效率是查全率和查准率的总称。查全率检出的相关文献量与文献库中所有相关文献量之比率。查准率检出的相关文献量与检出的文献总量之比率。,第一讲,第一节 医学生信息素质相关知识第二节 文献信息基础知识第三节 文献检索概述第四节 检索效率的评价第五节 影响检索效率的因素与提高 措施,第五节 影响检索效率的因素与提高措施,1、影响因素（1）检索工具（系统）不够完善。（2）检索者检索能力差。2、提高措施（1）提高标引质量，尽量完善检索系统（工具）。（2）正确制定检索策略。（3）根据检索要求适当调整查全率与查准率。,数据库结构的相关概念 字段(Field)： 组成记录的数据项就是字段，反映一篇文献的具体特征。如题名(TI)、著者(AU)、地址(AD)、出处(SO)、主题词(MeSH)、关键词(KW)、特征词(TG)、出版年(PY)、语种(LA)等。记录(Record)： 是构成数据库的基本信息单元，每条记录都描述了一个原始信息的外表和内容特征。一条记录通常由多个数据项组成，文献型数据库中的一条记录通常代表一篇文献。文档(File)： 是数据库中一部分记录的集合。许多大型数据库往往包含有数以万计的记录，为便利用户检索，常划分为若干文档。,字段1,字段3,字段2,字段4,字段5,记录3,记录1,记录2,1.布尔逻辑运算符,A. 逻辑“与”(AND ) 检索式：A AND B，表示记录中同时包含检索词A和检索词B的记录才是命中记录。 例如：肝炎 AND 肝癌 高血压 AND 糖尿病B. 逻辑“或”(OR ) 检索式：A OR B，表示记录中包含检索词A或检索词B，或者同时包含检索词A和检索词B的记录。 例如： 肝炎 OR 肝癌 维生素A OR 维生素BC. 逻辑“非”(NOT ) 检索式：A NOT B，表示记录中包含检索词A但同时不含检索词B的记录为命中记录。 例如：流感 NOT 咳嗽, (雌激素减少 AND 冠心病) NOT 更年期妇女,检索技巧：检索运算符,2.截词算符 截词检索是指截取检索词中的一部分进行文献检索的方式。截词方式有后截断（前方一致）、前截断（后方一致）、前后截断（中间一致）和中间截断（中间屏蔽）等四种方式。通常截词符有 “?”和“*”或“%”,“?”:替代一个字符。如“门?脉”，可检出：门静脉、门动脉等。“*”或“%”：替代任意个字符。如“肝炎%疫苗”，可检出：肝炎疫苗、肝炎病毒基因疫苗、肝炎减毒活疫苗、肝炎灭活疫苗等。comput*可查到computer、computing、computerized等。注意：？、*、%必须为半角状态。,3.强制执行符/短语检索符“”检索词做为短语或含有特殊符号“-”、“(”等，用英文半角双引号标识检索词，如： “1,25-(OH)2D3”,4. 位置运算符又称邻近度算符，适用于两个检索词在同一篇命中文献中需要指定间隔距离或出现顺序的检索运算符。with 同字段检索 例：A with B W/n 前后次序不定 例： A W/n BPRE/n 前后次序固定 例：A pre/n B,作业：,http:/,Thank you,